Проблемы толкования п.13 Инструкции № П-6 

Нет, не будет. Читаем следующий абзац п.13:

Если в этих документах отправитель указал вес продукции и количество мест, то получатель при приемке продукции должен проверить ее вес и количество мест.

Получатель вес и проверил. В чем проблема? Или у Вас теоретический интерес?
Тогда:
В п.13. речь идет о Международной системе единиц.
Что такое количество?
Количество - мерная характеристика предметов. В нашем случае измеряется такая характеристика предмета как вес.
Вес - количество вещества, определяемое мерой массы.
Грамм, килограмм, тонна – однородные единицы измерения массы, т.к. измеряют одну и ту же мерную характеристику предмета – вес.

Таким образом, под требованием Законодателя производить измерение в тех же единицах измерения следует понимать обязанность производить измерения одной и той же мерной характеристики предмета. Что и происходит без всяких недоразумений с 1965 года.

Степаньяк, у меня аналогичная позиция по этому вопросу, однако у представителей юридического департамента одной крупной нефтяной компании мнение по поводу толкования вышеуказанной нормы иное, поэтому и возник интерес к данной проблеме.
Поэтому не соглашусь с твоим высказыванием об отсутствии всяких недоразумений с 1965 года.

Любопытные кренделя сидят в этой компании. А что за контора? А то я знаю одного ущербного нефтяника, который мог такой перл выдать.

Компетентное мнение сотрудников юридического департамента одной нефтяной компании очень интересно, но еще интереснее какие последствия влечет их позиция на практике? Они не подписывают акт, или пытаются в суде доказать, что такой акт не является надлежащим доказательством по делу?

На практике такая позиция ведет к отказу в удовлетворении претензии по факту недостачи продукции.